组织工作存在的问题主要包括，作风不正、缺乏创新能力以及效率不高等。其中，作风不正影响到组织成员的激情和团结，使一些不良情绪弥漫其中，破坏组织整体气氛;缺乏创新意识意味着工作总是受到保守的影响，无法满足事业的发展需求;效率低则无法有效地完成各项工作，影响全面发展。此外，组织工作还受到各种不利因素的影响，如信息不对称、资源不充分、权力不均等，都会对组织工作的正常运行造成严重影响。