同期的地球,戈登·弗里曼正在麻省理工大学攻读博士学位。而在黑山研究所,一个名为“心灵传输”的实验,在研究员伊莱和克来纳博士的监督下也在进行中。这个“心灵传输”可以把人进行远距离的传输。通过“心灵传输”的技术,人类意外发现了与我们相邻的一个世界,也就是刚才提到的Xen。
黑山研究所的主要研究项目是“层叠共振实验”,为了研究“层叠共振实验”,不断有勘探小组被派遣到XEN星球采集实验样本,许多样本通过从XEN星球上采集到了地球。半条命1的玩家可能在XEN星上看到许多穿着HEV防护衣的尸体,那想必就是勘探小组的成员了。
2000年,戈登·弗里曼来到了黑山研究所工作。这时,黑山研究所的科学家决定对XEN星球的样本进行决定性的测试。测试就由身空HEV的来完穿防报服的戈登·弗里曼来完成了,当弗里曼将样本推入光波的一瞬间,层叠共振发生。科学家们过度地对样本进行决定性实验,导致了地球与Xen两个空间的合并,大量的外层空间生物闯入了这个混合体之中。